古DNA全基因组分析的一体化Docker镜像。
一个文件,docker load 即用。无需联网,无需配置环境。
将古代人类遗骨中提取的DNA测序数据,转化为祖源成分、单倍群归属、族群遗传距离等可读结果。面向考古实验室、古DNA研究组、基因族谱爱好者。
从原始测序数据到分析报告,一个镜像全部搞定
BWA-MEM 比对到 hg38、hg19、T2T 三套参考基因组。自动资源规划。
Yleaf v4,支持 ISOGG / YFull / FTDNA 三大系统树,古DNA模式。
Haplogrep3 + PhyloTree 17,从 chrM VCF 判定母系单倍群。
pileupCaller randomHaploid,1240K / 2M 位点集,支持 hg19 坐标交付。
23andMe、AncestryDNA、FTDNA、MyHeritage、LivingDNA,可上传各大平台。
E11、K13、K36、K47、HarappaWorld、globe13 等,直接计算祖源成分。
与 10,927 个现代人群 + 1,003 个古代样本比较遗传距离。
smartpca、qpAdm、PLINK、ADMIXTURE、mergeit、convertf 全套内置。
单个 tar 文件,docker load 即用。全部参考数据内置,支持 Linux / macOS / Windows。
从原始数据到交付结果的完整链路