开源免费 · MIT License · v1.3.0

WGS-All

古DNA全基因组分析的一体化Docker镜像。
一个文件,docker load 即用。无需联网,无需配置环境。

将古代人类遗骨中提取的DNA测序数据,转化为祖源成分、单倍群归属、族群遗传距离等可读结果。面向考古实验室、古DNA研究组、基因族谱爱好者。

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19
CLI 命令
28
祖源计算器
3
参考基因组
11
芯片格式

核心能力

从原始测序数据到分析报告,一个镜像全部搞定

🧬

序列比对

BWA-MEM 比对到 hg38、hg19、T2T 三套参考基因组。自动资源规划。

🌳

Y 单倍群

Yleaf v4,支持 ISOGG / YFull / FTDNA 三大系统树,古DNA模式。

🧫

MT 单倍群

Haplogrep3 + PhyloTree 17,从 chrM VCF 判定母系单倍群。

📦

EIGENSTRAT 导出

pileupCaller randomHaploid,1240K / 2M 位点集,支持 hg19 坐标交付。

💾

11 种芯片格式

23andMe、AncestryDNA、FTDNA、MyHeritage、LivingDNA,可上传各大平台。

🧮

28 个祖源计算器

E11、K13、K36、K47、HarappaWorld、globe13 等,直接计算祖源成分。

🌍

G25 距离计算

与 10,927 个现代人群 + 1,003 个古代样本比较遗传距离。

📊

群体遗传工具

smartpca、qpAdm、PLINK、ADMIXTURE、mergeit、convertf 全套内置。

🐳

零依赖部署

单个 tar 文件,docker load 即用。全部参考数据内置,支持 Linux / macOS / Windows。

分析流程

从原始数据到交付结果的完整链路

FASTQ BAM (hg38/hg19/T2T) chrY / chrM Y/MT 单倍群
BAM EIGENSTRAT (.geno/.snp/.ind) PCA / qpAdm
BAM 芯片格式 (23andMe...) 祖源计算器 / G25

开源免费

WGS-All 采用 MIT License 开源。所有代码和分析流程完全免费使用,无需注册,无需付费。拿到镜像文件,加载即用。

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